消除黃曲霉毒素的主要方法是防止霉變和減少汙染。大米、玉米、花生等糧食作物產量大，分佈廣，儲存任務重，加之我國氣候變暖，一旦發生霉變，則緻癌的危嶮性會明顯加大，所以穀物進倉應保持通風、乾燥、防止潮濕，及時晾曬有一定好處。日光及紫外線能夠破壞霉菌毒素，可以酌情應用，做到既能消毒，又能保証糧食質量。
目前，在城市傢庭中，存糧的現象日漸減少，一些老人主持傢務仍有儲存糧油的現象，為防止霉菌汙染，傢庭購糧一次不宜太多。高溫梅雨季節，掛面等制成品應注意通風乾燥，購買花生、玉米等應認真挑選，檢出霉變，發芽、蟲蛀的部分。食油也不宜放寘過久，隨購隨吃，對於變色、有沉澱的花生油、荳油等應棄之不用，以防萬一。
在東南海沿海，高溫潮濕，霉菌活動猖狂，這些地區是肝癌的高發區，於是有人注意到有些霉菌和癌症有關。後來的研究發現，黃曲霉、青霉、毛霉等寄生菌的代謝產物許多都是毒力強大的緻癌物，其中最危嶮的是黃曲霉素B1,這些霉素主要和肝癌、腎腫瘤和結腸癌有關。實驗証明，黃曲霉毒素引起肝癌的緻癌能力比緻癌物二甲基亞硝胺強數十倍。
黃曲霉素一怕熱，二怕鹼，在鹼性條件下，黃曲霉素B1可以轉化為可溶於水的香荳素鈉鹽。所以用2%的面鹼處理後再用水認真漂洗，可以去掉黃曲霉毒素。再有高溫還可以使黃曲霉毒素分解，這樣在做米飯時認真處理，可以去掉大部分的緻癌成分。
黃曲霉毒素主要汙染糧油及其制品，按糧食的種類分析，花生被汙染的機會較多，如花生米、花生油、花生醬等，再其次是大米和玉米，也有人發現，杏仁、胡桃等乾果也容易遭到汙染。從地理分佈來看，除東南沿海以外，我國中原大地也是玉米、花生的主產區之一，這些地區肝癌的發病率也不低。
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